El curso de Maestría en Química Aplicada del Programa de Pos-Graduación en Química de la Universidad Estadual del Centro Oeste (UNICENTRO) fue aprobado en reunión realizada en el periodo del 31 de Enero al 02 de Febrero de 2006 por el consejo técnico científico (CTC) de Capes que concordó con el parecer de la comisión de Área y recomendó el concepto 3. De esta manera la maestría en química aplicada inicio sus actividades en 2006 actuando en dos líneas de investigación: (1) Materiales, interfaces, y aplicaciones (2) Metodologías analíticas y aplicaciones.
A lo largo de su existencias, el cuerpo docente de la maestría en química aplicada se ha comprometido en buscar el fortalecimiento de las líneas de investigación, la consolidación de los grupos de investigación, la aprobación y preparación de nuevos proyectos y la publicación de artículos científicos en revistas nacionales e internacionales de alto factor de impacto.
El programa de pos-graduación en química aplicada, nivel maestría ha procurado también ofrecer a sus Mestres una formación amplia y versátil capacitándolos para actuar en diversos sectores industriales y académicos sin dejar de lado la formación científica que permita la continuación de sus estudios visando un curso de doctorado.